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在南京，以下一些机构可能开展干细胞治疗脑萎缩相关的研究或治疗：
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解放军南京 454 医院：该医院神经科技术力量雄厚、科研业务能力强，在神经变性病的治疗上有丰富经验。2003 年率先在国内开展自体骨髓干细胞蛛网膜下腔移植治疗运动神经元病，对于神经变性病（包括脑萎缩）的干细胞移植治疗有一定的探索和实践。赖福生主任医师擅长神经系统变性疾病的治疗，尤其对干细胞治疗神经系统各类疾病有独到研究。
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南京南医大干细胞实验室（可能与南方医科大干细胞中心有合作）：有信息提到 “南京南医大干细胞实验室 = 南方医科大干细胞中心治疗脑萎缩”。但需要注意的是，这可能是一些机构或平台发布的信息，具体的治疗情况和资质还需要进一步了解和确认。
不过，干细胞治疗脑萎缩目前仍处于研究和探索阶段，虽然在一些临床实践中显示出一定的潜力，但治疗效果还存在不确定性。需要提醒的是，患者在选择任何医疗服务尤其是涉及干细胞治疗时，一定要谨慎，患者可以添加网站客服微信，免费咨询了解不同机构的特点和优势。确保选择合法、正规、经过严格审批和监管的机构，以避免遭受不必要的风险和损失。
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